歐奇奧 IPAC2蛋白質(zhì)聚集體計(jì)數(shù)分析儀
蛋白質(zhì)是怎樣構(gòu)成的?
蛋白質(zhì)是以氨基酸為基本單位構(gòu)成的生物高分子。蛋白質(zhì)分子上氨基酸的序列和由此形成的立體結(jié)構(gòu)構(gòu)成了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的多樣性。蛋白質(zhì)具有一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)、四級(jí)結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)決定了它的功能。
一級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。
二級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子局區(qū)域內(nèi),多肽鏈沿一定方向盤繞和折疊的方式。
三級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上借助各種次級(jí)鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的空間構(gòu)象。
四級(jí)結(jié)構(gòu):多亞基蛋白質(zhì)分子中各個(gè)具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈,以適當(dāng)?shù)姆绞骄酆纤纬傻牡鞍踪|(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。
蛋白質(zhì)的氨基酸序列是由對(duì)應(yīng)基因所編碼。除了遺傳密碼所編碼的20種“標(biāo)準(zhǔn)”氨基酸,在蛋白質(zhì)中,某些氨基酸殘基還可以被翻譯后修飾而發(fā)生化學(xué)結(jié)構(gòu)的變化,從而對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行激活或調(diào)控。但是,如果蛋白質(zhì)間發(fā)生非特異性結(jié)合,不僅蛋白質(zhì)失去應(yīng)有活性,而且易形成包涵體,導(dǎo)致蛋白基因工程成本增加。聚集體的結(jié)構(gòu)包括淀粉樣蛋白纖維結(jié)構(gòu)和包涵體結(jié)構(gòu)。
生物醫(yī)學(xué)工程中為什么必須研究和觀測(cè)蛋白質(zhì)聚集體?
蛋白質(zhì)聚集已經(jīng)成為藥物與生物學(xué)領(lǐng)域中的研究熱點(diǎn),其中蛋白質(zhì)以非天然構(gòu)象存在,還常伴隨著β-折疊量的增加。老年癡呆癥和II型糖尿病都與蛋白質(zhì)聚集有關(guān)。研究蛋白質(zhì)聚集體有助于理解體內(nèi)分子病的形成。
在蛋白質(zhì)和藥物的后基因組時(shí)代,尋找蛋白質(zhì)晶體的優(yōu)化條件一直是晶體生長(zhǎng)工作者的目標(biāo)。而成核前溶液中蛋白質(zhì)形成的聚集體的狀態(tài)(包括聚集體的大小,形貌,甚至于構(gòu)象等)的變化會(huì)直接影響到成核的情況。因此,對(duì)于無序聚集體狀態(tài)的變化研究,有助于分析有序聚集體的出現(xiàn)條件并提供蛋白質(zhì)晶體生長(zhǎng)的合適條件。
清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物膜與膜生物工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室購(gòu)置“多角度激光光散射凝膠色譜系統(tǒng)”,用于生物樣品溶液形態(tài)分析、蛋白質(zhì)及其聚集體分子量和分布測(cè)定,蛋白質(zhì)均一性、穩(wěn)定性分析及其結(jié)晶狀態(tài)和條件的篩選,研究蛋白質(zhì)聚集體對(duì)膜污染過程的影響。
蛋白聚集嚴(yán)重影響以蛋白為基礎(chǔ)研發(fā)的藥物。在藥物制劑中,蛋白聚集在生物活性和免疫原性方面影響藥效。蛋白聚集發(fā)生在生產(chǎn)過程的各個(gè)階段包括細(xì)胞培養(yǎng)、純化、生產(chǎn)、儲(chǔ)存、運(yùn)輸?shù)确矫妗V扑幑I(yè)希望在生物工藝中找到新的方法,可用于檢測(cè)、追蹤、定量分析影響蛋白聚集的因素。近年來以凍干穩(wěn)定形式存在的蛋白聚集體作為標(biāo)準(zhǔn)品,可以地定量檢測(cè)蛋白聚集,加上新穎的只需在酶標(biāo)儀里即可實(shí)驗(yàn)的ProteoStat® protein aggregation assay,可對(duì)蛋白檢測(cè)方法進(jìn)行優(yōu)化。
科學(xué)家目前并不確定為何不正確的蛋白質(zhì)形式和聚集成團(tuán)現(xiàn)象是神經(jīng)變性疾病的重要標(biāo)志,神經(jīng)變性疾病包括肌側(cè)索硬化(ALS)、阿爾茲海默氏癥和瘋牛病等。刊登在11月1日的雜志Molecular Cell上的研究報(bào)告中,來自耶魯大學(xué)的研究者通過在細(xì)菌中研究疾病的發(fā)病過程來揭示不正確形式的蛋白質(zhì)的聚集體的形成過程。蛋白質(zhì)是由DNA編碼控制并且在核糖體的裝配下在細(xì)胞中形成,然而,有時(shí)候蛋白質(zhì)并不會(huì)被正確地裝配,這些錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)就趨向于聚集。錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì)的聚集現(xiàn)象就在阿爾茲海默癥患者大腦中表現(xiàn)尤為明顯。來自耶魯?shù)难芯繄F(tuán)隊(duì)揭示了抗生素鏈霉素可以誘發(fā)大腸桿菌蛋白質(zhì)的聚集。使用大規(guī)模的蛋白質(zhì)組學(xué)及遺傳學(xué)篩選技術(shù),研究者分析了蛋白質(zhì)的聚集現(xiàn)象以及篩選了可以使得大腸桿菌對(duì)抗生素產(chǎn)生耐藥性的細(xì)菌蛋白質(zhì),zui終研究者發(fā)現(xiàn)細(xì)菌中一種特殊的蛋白質(zhì)如何保護(hù)細(xì)菌免于過氧化氫的壓力,以及這種蛋白質(zhì)如何減弱由于鏈霉素所刺激引發(fā)的蛋白質(zhì)的聚集。
蛋白質(zhì)中聚集體的直接可視化、尺寸測(cè)量和計(jì)數(shù):檢測(cè)蛋白質(zhì)聚集狀態(tài)對(duì)了解生物醫(yī)藥產(chǎn)品的穩(wěn)定性和功效是至關(guān)重要的。當(dāng)有蛋白質(zhì)聚集體時(shí),對(duì)產(chǎn)品的質(zhì)量的生物活性和原免疫性兩方面有很大的影響。很多聚集體遇到生物樣品會(huì)按照大小和特性排列(如:可溶的和不可溶的,共價(jià)的和非共價(jià)的或者可逆的和不可逆的)。蛋白質(zhì)聚集體的范圍跨度很大,從小型的低聚體(納米級(jí))到包含成百萬的單體單元構(gòu)成的不可溶的微米級(jí)的聚集體。
在制造過程(細(xì)胞培養(yǎng)、提純、形成)、貯存、分配和產(chǎn)品處理過程中的任何一步都可能產(chǎn)生蛋白質(zhì)聚集體。它可能是由于各種壓力引起的,比如,攪拌、暴露在的pH下、溫度、離子強(qiáng)度或者各種界面(如,氣-液界面)。在高蛋白含量(像單克隆抗體形成的情況)情況下,會(huì)出現(xiàn)進(jìn)一步增加聚集體的可能性。因此,在開發(fā)、
制造以及藥物的后續(xù)貯存和描述產(chǎn)物時(shí)都必須仔細(xì)描述和控制聚集體。同樣地,可以通過監(jiān)測(cè)聚集體的狀態(tài),修改或者優(yōu)化生產(chǎn)過程來實(shí)現(xiàn)。
現(xiàn)在FC-200S-IPAC提供一種以藍(lán)光為基礎(chǔ)的圖像法亞微米粒子跟蹤分析系統(tǒng),可以直接在液相中實(shí)時(shí)地觀測(cè)到單個(gè)的納米級(jí)粒子(如蛋白質(zhì)聚集物)并且對(duì)其計(jì)數(shù),并獲得高分辨率的粒度分布圖。該技術(shù)具有快速、可靠、的特點(diǎn)并且成本遠(yuǎn)低于掃描電鏡,這些特點(diǎn)使之成為現(xiàn)存納米顆粒分析方法(如DLS(動(dòng)態(tài)光散射又稱光子相關(guān)光譜PCS,)或者電子顯微鏡(EM))的很好的替代或者補(bǔ)充